مبانی بیوانفورماتیک کاربردی
نویسنده:
دکتر مریم عظیم زاده ایرانی
مترجم:
سال نشر:
۱۴۰۲
صفحه:
۱۰۰
نوبت چاپ:
۱

کتاب مبانی بیوانفورماتیک کاربردی با تمرکز بر به روزترین مطالب درباره پایگاه‌های داده و رایانش ابری داده‌های زیستی نگاشته شده است. از آنجا که در سال‌های اخیر پایگاه‌های داده و نحوه استفاده از آن‌ها برای تحلیل داده‌های زیستی به شدت متحول شده، رایانش ابری متداول گردیده و تحلیل اطلاعات در سیستم‌های کامپیوتر محلی دیگر چندان مورد استفاده نیست. در این کتاب جدیدترین روش‌های استفاده از به روزترین پایگاه‌های داده آموزش داده شده است. تحلیل، بررسی و ذخیره اطلاعات همگی به صورت ابری و بدون نیاز به صرف هزینه برای سیستم محلی، ذخیره‌سازی، نرم‌افزارها و پروژه‌ها انجام گرفته است. هدف کاربردی بودن مبانی در این کتاب با انتقال مفاهیم دقیق و گزیده محقق شده است.

 در منابع محدودی که به صورت ترجمه و تألیف برای مبانی بیوانفورماتیک موجود هستند، می‌توان به دو نقطه ضعف عمده اشاره کرد؛ یکی، کاربردی بودن افراطی به معنی تمرکز بر معرفی و آموزش استفاده از نرم‌افزارها و پایگاه‌های داده و دیگری تئوری گسترده و تمرکز بر تشریح مفاهیم زیستی، آمار، ریاضی و مدل‌سازی.  در این کتاب تلاش شده که ضمن پرداختن به هر دو جنبه، توازن بار معنایی میان تئوری و کاربرد بر قرار باشد.

 

 فصل اول مفاهیم، شاخه‌ها و تاریخچه بیوانفورماتیک ۱۳

 ۱-۱ تعریف بیوانفورماتیک و معرفی اجمالی مهم‌ترین شاخه‌ها ۱۳

 ۲-۱ دانش میانرشته‌ای

 ۳-۱ خلاصهای از تاریخچه بیوانفورماتیک ۱۷

 ۴-۱ حوزه‌های کاربردی بیوانفورماتیک ۱۸

 فصل دوم پایگاه‌های داده ۲۱

 ۱-۲ پروتئین‌ها ۲۱

 ۱-۱-۲ PDB  ۲۱

 ۲-۱-۲  SCOP  ۲۸

 ۳-۱-۲ CATH  ۳۳

 ۲-۲ ریزمولکول‌ها: Pubchem  ۳۶

 ۳-۲ ژن‌ها: NCBI  ۴۱

 ۱-۳-۲ منابع NCBI  ۴۲

 ۲-۳-۲  RefSeq  ۴۲

 ۳-۳-۲ جست‌وجو در NCBI  ۴۲

 ۴-۳-۲  Genome Data Viewer۴۵

 ۴-۲ تمرین ۴۸

 فصل سوم همردیفی توالی ۵۰

 ۱-۳ مفاهیم ۵۰

 ۲-۳ نمایش همردیفی ۵۱

 ۳-۳ ماتریسهای هم‌ردیفی ۵۲

 ۱-۳-۳ توالی‌های نوکلئوتیدی: ماتریسهای همانی ۵۲

 ۲-۳-۳ توالی‌های پروتئینی: ماتریسهای جایگزینی ۵۳

 ۴-۳ هم‌ردیفی سراسری و موضعی ۵۵

 ۱-۴-۳ هم‌ردیفی سراسری ۵۵

 ۲-۴-۳ هم‌ردیفی موضعی ۵۶

 ۵-۳ هم‌ردیفی چندگانه توالی ۵۷

 ۶-۳ انجام هم‌ردیفی به کمک NCBI ۵۸

 ۷-۳ ابزار پایه‌ای جستجو هم‌ردیفی موضعی (BLAST) ۶۴

 فصل چهارم درخت تبارزایشی ۶۹

 ۱-۴ مفاهیم و کاربردهای درخت تبارزایشی ۷۰

 ۲-۴ ساختار و اجزای درخت تبارزایشی ۷۱

 ۳-۴ رویکرد بهینگی- حداکثری و تکامل حداقلی ۷۲

 ۴-۴ رسم درخت تبارزایی به کمک NCBI ۷۴

 ۵-۴ تمرین ۸۰

 فصل پنجم مدل‌سازی با استفاده از همولوژی ۸۲

 ۱-۵ مفاهیم ۸۲

 ۲-۵ مراحل مدل‌سازی همولوژی ۸۲

 ۳-۵ مدل‌سازی با استفاده از SWISS-MODEL ۸۴

 ۴-۵ تمرین ۹۳

 منابع  ۹۴

دسته بندی موضوعی موضوع فرعی
فنی و مهندسی مهندسی شيمي

تمامی حقوق این سایت برای سازمان ترویج مطالعه و نشر جهاد دانشگاهی محفوظ است. نقل مطالب با ذکر منبع بلامانع است.
Copyright ©۲۰۲۵ Iranian Students Booking Agency. All rights reserved