کتاب روش‌های مولکولی در زیست شناسی گیاهی که ترجمه ای از کتاب ارزشمند «Molecular Methods in Plant Biology» می باشد، به اهتمام و نظارت عضو هیات علمی پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی و با همکاری محققان دانشگاهی منتشر شد.

معرفی و مقدمه -  9

روش‌های مولکولی در زیست‌شناسی گیاهی- 10

چکیدهای بر واحدهای متریک Metric Units -11

نمودار جریان پروتک لها - توالی DNA  بافت‌های گیاهی - 11

بخش 2

استخراج DNA  ژنومی گیاهان- 13

ملاحظات عمومی و اصول - 14

استخراج DNA ژنومی گیاه با استفاده از CTAB: روش آماده سازی کوتاه (Mini Prep) -16  

استخراج DNA ژنومی با استفاده از CTAB  است: در مقیاس بزرگ -18

استخراج DNA ژنومی  (Mini Prep) برای گیاهان با کربوهیدرات بالا -21

خالص سازی سزیم کلرید از DNA  ژنومی -23

خالص سازی PEG  از DNA ژنومی -25

روش تمیز کردن اسپین  )چرخش(  ژل DNA  ژنومی -27

استخراج DNA اقاقیا: روش Miniprep  - 29

آماده‌سازی DNA گیاهی ( Miniprep): روشی کوتاه برای نمونه‌های خشک -31

بخش 3

استخراج RNA گیاهی - 33

ملاحظه عمومی و توضیح اصول -34

استخراج RNA با استفاده از بافر بورات داغ - 35

روش جداسازی TRIzol RNA -38

استخراج ساده RNA گیاهی -41

بخش 4

غلظت اسید نوکلئیک Fluorometry -43

بخش 5

الکتروفورز ژل آگارز  -45

آماده سازی مینی ژل‌ها )ژل‌های کوچک) -46

آماده سازی نمونه‌ها و جاری شدن ژل‌های کوچک -47

رنگ آمیزی و تصویربرداری مینی ژل‌ها -48

غیرفعال کردن اتیدیوم بروماید -50

بخش 6

واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

چگونگی انجام PCR - 52

تقویت یا افزایش تقارن -53

تکثیر عادی ژن‌ها -56

بخش 7

تخلیص محصولات PCR برای استفاده در واکنش‌های تعیین توالی - 67

خالص سازی ستون با استفاده از چرخه EZNA - کیت خالص -68

ژل خالص محصولات PCR  با استفاده از کیت استخراج ژل Qiaquick- 69

پروتکل غشاءDEAE Nylon - 70

هدایت مستقیم رسوب محصولات PCR  با استفاده از PEG -72

بخش  8

شبیه سازی TA (cloning) و تعیین توالی محصولات PCR  -73

معرفی -74

 انعقاد و شبیه‌سازی محصولات PCR - 77

تغییر شکل سلول‌های مناسب: روش شیمیایی  )شوک حرارتی) – 78

آماده‌سازی کوچک (Mini-prep) پلازمید: روش ستون EZNA -79

آماده‌سازی کوچک  (Mini-prep) و درج تاییدیه پلازمید: روش Alkaline Lysis - 81

جلوگیری تجزیه پلازمید DNA - 82

کلنی PCR: پیشنهاد آماده‌سازی کوچک (Mini-prep) -82

بخش 9

واکنش‌های تعیین توالی DNA  - 85

چگونگی واکنش‌های تعیین توالی -86

چرخه تعیین توالی -88

خالص کردن محصولات چرخه تعیین توالی با استفاده از ستونهای سفادکس CENTRI SEP/ -89

تصفیه چرخه توالی محصولات از طریق بارش اتانول - 90

بخش 10

تعیین توالی خودکار  DNA ABI 337 - 93

قبل از جاری شدن ژل - 94

تمیز کردن و نصب و را هاندازی صفحات و ریختن ژل -95

کارهایی که باید در حین پلیمرازسیون ژل انجام دهیم - 98

بارگیری ژل و جاری شدن - 101

بعد از جاری شدن - 103

اصلاح و پیرایش پروتکل در هنگام استفاده از "شانه‌های غشاء" - 104   

صدور داده ها به کامپیوترهای دیگر - 106

ویرایش اطلاعات تعیین توالی - 107

تفسیر داده های توالی- 107

بخش 11

محدودیت گوارش و ساترن بلات Southern Blotting -109

محدودیت گوارش DNA گیاهی - 110

الکتروفورز ژل آگارز به وسیله محدودیت گوارش و هضم -110

ساترن بلات Southern Blotting - روش انتقال مرطوب -111

بخش 12

 هیبریداسیون غیر رادیواکتیو -113

ساخت کاوشگر با استفاده از دی اکسیژنین در تقویت PCR -114

هیبریداسیون با کاوشگر نشان دار دیگوکسیژنین -115

تشخیص Chemiluminescent از Digoxigenin- نشاندار کردن کاوشگر هیبریداسیون -117

بخش  13

دستورالعمل محلول -119

بخش  14

اطلاعات تکمیلی  -131

بخش  15

منابع  -147